宏基因組下一代測(cè)序技術(shù)問世

科技日?qǐng)?bào)北京11月13日電 (記者張夢(mèng)然)據(jù)12日發(fā)表于《自然·醫(yī)學(xué)》雜志的論文,美國加州大學(xué)舊金山分校科研團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)了一種宏基因組下一代測(cè)序(mNGS)技術(shù),該技術(shù)能夠在短時(shí)間內(nèi)檢測(cè)出包括病毒、細(xì)菌、真菌及寄生蟲在內(nèi)的多種病原體。這項(xiàng)歷時(shí)10年的研究成果,預(yù)示著其在診斷由腦膜炎和腦炎等疾病引起的神經(jīng)系統(tǒng)感染方面有著巨大潛力,并有望加速對(duì)新興病毒性大流行病原體的識(shí)別。

mNGS的工作原理是對(duì)樣本中所有的核酸,即RNA和DNA進(jìn)行全面分析,而非針對(duì)單一病原體進(jìn)行檢測(cè)。這種方法通過一次性的全面篩查替代了傳統(tǒng)的多次檢測(cè)流程,使醫(yī)生在面對(duì)感染性疾病時(shí)能夠更迅速地作出準(zhǔn)確診斷和治療決定。

此外,團(tuán)隊(duì)還在《自然·通訊》雜志上同期發(fā)表了相關(guān)研究,展示了mNGS技術(shù)在呼吸道液體樣本中識(shí)別導(dǎo)致肺炎的病原體,并實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的應(yīng)用。團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,這種自動(dòng)化測(cè)試不僅能夠加快對(duì)呼吸道傳染病的病原體檢測(cè)速度,而且還有助于早期發(fā)現(xiàn)可能引發(fā)新的全球大流行的未知病毒。

從2016年到2023年,加州大學(xué)舊金山分校研究人員運(yùn)用這一檢測(cè)技術(shù)分析了大約5000份腦脊液樣本,其中14.4%的樣本被確認(rèn)存在感染情況。在這些案例中,mNGS技術(shù)對(duì)于病原體的識(shí)別準(zhǔn)確率達(dá)到了86%。同時(shí)研究也表明,即使在病毒數(shù)量極少的情況下,mNGS也能在24小時(shí)內(nèi)檢測(cè)出具有大流行潛力的呼吸道病毒,包括新冠病毒、流感病毒(A/B型)以及呼吸道合胞病毒。

在應(yīng)對(duì)未來可能出現(xiàn)或進(jìn)化后的病毒種類方面,團(tuán)隊(duì)用mNGS技術(shù)進(jìn)行了模擬測(cè)試。結(jié)果顯示,該技術(shù)理論上可以檢測(cè)出所有潛在的新病毒。

【總編輯圈點(diǎn)】

神奇的mNGS測(cè)序測(cè)試,提供了一種客觀、全面且權(quán)威的病原體檢測(cè)手段。更重要的是,科學(xué)家還看到了將mNGS技術(shù)納入臨床檢測(cè)中的重要性。因?yàn)楦鶕?jù)現(xiàn)有研究結(jié)果,mNGS不僅在快速診斷各類型病原體方面展現(xiàn)了奇效,還能夠迅速確定感染源——這對(duì)于優(yōu)化被感染者的候選治療方案有很大幫助,進(jìn)而大幅減少醫(yī)療開支。

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