新研究填補(bǔ)全球基因組“南方盲區(qū)”

記者15日從中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所(以下簡(jiǎn)稱“昆明動(dòng)物研究所”)獲悉,由該所牽頭聯(lián)合東南亞多國科研機(jī)構(gòu),歷經(jīng)10年攻關(guān)的“東南亞人群基因組計(jì)劃”取得首期重要進(jìn)展。該研究首次系統(tǒng)揭示東南亞大陸人群遺傳結(jié)構(gòu)與演化歷史,填補(bǔ)了研究空白。國際期刊《自然》于北京時(shí)間5月14日發(fā)表了相關(guān)成果。

作為全球人類基因組研究的重要區(qū)域之一,東南亞擁有近3億人口,涵蓋多種民族、語言和文化形態(tài)。然而,該地區(qū)長(zhǎng)期缺乏系統(tǒng)性的基因組研究。為填補(bǔ)這一空白,昆明動(dòng)物研究所聯(lián)合泰國、柬埔寨等多國科研機(jī)構(gòu),開展了大型基因組計(jì)劃,覆蓋了5大語系、6個(gè)國家30多個(gè)地方的東南亞人群,并完成了深度全基因組測(cè)序。

研究團(tuán)隊(duì)首次系統(tǒng)解析了東南亞人群的基因組多樣性,檢測(cè)到4種關(guān)鍵遺傳成分,其中以柬埔寨及安達(dá)曼群島人群的獨(dú)特祖先成分居多,可能源自古老人群。此外,研究表明,在末次冰期后,東南亞人口經(jīng)歷了明顯的瓶頸效應(yīng),隨后因農(nóng)業(yè)擴(kuò)張而快速爆發(fā)式增長(zhǎng),揭示了其獨(dú)特的遺傳結(jié)構(gòu)和進(jìn)化歷史。

通過分析基因組數(shù)據(jù),研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)了大量與熱帶雨林環(huán)境適應(yīng)相關(guān)的關(guān)鍵基因。如SLC24A5基因幫助皮膚抵御強(qiáng)紫外環(huán)境,CDC42SE2基因可減輕蚊蟲叮咬反應(yīng)等;首次鑒定出東南亞人群特異富集的大規(guī)模結(jié)構(gòu)變異,并揭示了這些變異可能通過自然選擇實(shí)現(xiàn)適應(yīng)。

研究還發(fā)現(xiàn),東南亞人群中存在多次丹尼索瓦人基因滲入的模式及對(duì)當(dāng)?shù)厝巳哼m應(yīng)熱帶雨林環(huán)境貢獻(xiàn)顯著,鑒定出多個(gè)涉及代謝調(diào)節(jié)、免疫增強(qiáng)及肌肉發(fā)育等關(guān)鍵功能的古人類基因片段,解析了東南亞地區(qū)高發(fā)疾病的進(jìn)化模式,鑒定出10個(gè)東南亞特異高頻致病變異和189個(gè)全新純合子基因功能喪失變異,為探索罕見病與遺傳變異關(guān)聯(lián)提供模型,對(duì)疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估與遺傳咨詢意義重大。

此項(xiàng)成果填補(bǔ)了全球基因組“南方盲區(qū)”,標(biāo)志著全球人類基因組多樣性研究的重大突破,為人類表型與環(huán)境互作機(jī)制、熱帶疾病遺傳基礎(chǔ)研究提供支撐。目前,二期工程已啟動(dòng),旨在構(gòu)建覆蓋東南亞全域的萬人級(jí)基因組圖譜,為區(qū)域精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)和跨境健康治理提供關(guān)鍵支撐,持續(xù)引領(lǐng)人類多樣性研究的國際合作范式。

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