德國(guó)生物信息學(xué)家發(fā)現(xiàn)新冠病毒新弱點(diǎn)

德國(guó)生物信息學(xué)家發(fā)現(xiàn)新冠病毒新弱點(diǎn)
  人體中有影響病毒繁殖的酶

國(guó)際戰(zhàn)“疫”行動(dòng)

科技日?qǐng)?bào)柏林1月11日電 (記者李山)近日,德國(guó)的生物信息學(xué)家通過(guò)計(jì)算機(jī)模型識(shí)別出人體中一種對(duì)新冠病毒繁殖至關(guān)重要的酶,如果抑制這種酶,病毒就會(huì)停止繁殖而不影響宿主細(xì)胞。該研究有助于找到對(duì)抗新冠病毒感染的新方法。

除了疫苗,尋找有效的治療新冠病毒感染的藥物也是戰(zhàn)勝疫情的重要手段之一。現(xiàn)在,來(lái)自德國(guó)感染研究中心和蒂賓根大學(xué)的德?tīng)柛癫┦考捌鋱F(tuán)隊(duì)通過(guò)一種新穎的方法發(fā)現(xiàn)了新冠病毒的一個(gè)弱點(diǎn),可以用來(lái)開(kāi)發(fā)針對(duì)性的藥物。生物信息學(xué)家使用計(jì)算機(jī)模型識(shí)別出了一種對(duì)病毒至關(guān)重要的人類酶。德?tīng)柛癫┦空f(shuō):“如果我們關(guān)閉這種酶——鳥(niǎo)苷酸激酶1(GK1),病毒就會(huì)停止繁殖而不會(huì)影響宿主細(xì)胞。”

德?tīng)柛耦I(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)從2020年1月就開(kāi)始進(jìn)行有關(guān)新冠病毒的研究,他同時(shí)還是蒂賓根大學(xué)的青年教授,負(fù)責(zé)基于計(jì)算機(jī)的系統(tǒng)生物學(xué)研究,重點(diǎn)是優(yōu)化生物技術(shù)過(guò)程和分子水平上疾病的發(fā)展和進(jìn)程。他們成功開(kāi)發(fā)出帶有新冠病毒和人類肺泡巨噬細(xì)胞的集成計(jì)算機(jī)模型。巨噬細(xì)胞主要負(fù)責(zé)防御肺泡中的異物,德?tīng)柛裾f(shuō):“(此前)關(guān)于這些巨噬細(xì)胞已經(jīng)有一個(gè)復(fù)雜的計(jì)算機(jī)模型,為了研究新冠病毒我們進(jìn)一步進(jìn)行了開(kāi)發(fā)。”

模型的起點(diǎn)是病毒已經(jīng)滲透進(jìn)入宿主(即模型中的人類肺泡巨噬細(xì)胞),并且已經(jīng)對(duì)其進(jìn)行重新編程。假如病毒想要產(chǎn)生新的病毒顆粒并傳播,那么它必須使用來(lái)自宿主的材料并迫使宿主細(xì)胞產(chǎn)生新的病毒成分。德?tīng)柛裾f(shuō):“病毒在宿主中使用的生化反應(yīng)已經(jīng)被整合到了模型中。我們首先分析病毒的成分,然后計(jì)算出產(chǎn)生病毒顆粒所需的材料,并查看病毒感染期間宿主細(xì)胞中的生化反應(yīng)如何發(fā)生變化。”

在所謂的流量平衡分析中,科學(xué)家們系統(tǒng)地測(cè)試了在受感染的細(xì)胞中與未受感染的細(xì)胞中哪些生化反應(yīng)發(fā)生的情況不同。通過(guò)這些反應(yīng),他們可以開(kāi)始進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)。通過(guò)專門(mén)關(guān)閉選定的反應(yīng),他們追蹤了對(duì)病毒特別重要的過(guò)程。例如,在鳥(niǎo)苷酸激酶1關(guān)閉時(shí)可完全阻止病毒繁殖。在肺泡巨噬細(xì)胞中這種酶在核糖核酸(RNA)構(gòu)件的代謝中起重要作用,因此對(duì)新冠病毒RNA的構(gòu)成也起著決定性作用。

德?tīng)柛窠忉屨f(shuō):“沒(méi)有GK1病毒就無(wú)法復(fù)制,但是人類細(xì)胞卻可以切換到其他生化代謝途徑。”如果想用活性成分抑制酶而又不會(huì)對(duì)人體造成不良副作用,這是重要的先決條件。目前,德?tīng)柛駡F(tuán)隊(duì)正與弗勞恩霍夫分子生物學(xué)和應(yīng)用生態(tài)學(xué)研究所的伯哈德·艾林格爾博士合作,測(cè)試抑制劑對(duì)新冠病毒的有效性。一些酶的抑制劑是已知的,位于漢堡的弗勞恩霍夫研究所有一個(gè)完整的庫(kù),包含5600多種活性物質(zhì),最關(guān)鍵的是所有這些物質(zhì)都已被批準(zhǔn)可以安全地用于人體。

即便如此,科學(xué)家們?cè)趯?shí)驗(yàn)室中找到合適的活性成分之后,還必須進(jìn)行嚴(yán)格的試驗(yàn)。先在動(dòng)物中,然后在人體中。因?yàn)橹挥羞@樣,人們才可以完整地掌握活性成分和免疫系統(tǒng)之間產(chǎn)生的相互作用。專家們預(yù)計(jì),如果一切順利,這種針對(duì)新冠病毒的藥物,在經(jīng)過(guò)臨床試驗(yàn)后,最早可能會(huì)在2021年年底獲批。艾林格爾解釋說(shuō):“也許我們不能百分百抗擊這種病毒,而只會(huì)阻止90%或85%的病毒繁殖。但只要為免疫系統(tǒng)贏得足夠的時(shí)間,結(jié)果就顯而易見(jiàn)。此外,值得期待的還有,這種針對(duì)病毒的基本方法能夠適用于新冠病毒的所有突變。”

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