(抗擊新冠肺炎)上海推出“病毒基因組檢測分析平臺” 疫情期間在線免費向社會開放
中新網(wǎng)上海1月8日電 (鄭瑩瑩)據(jù)上海科技創(chuàng)新資源數(shù)據(jù)中心(以下簡稱：數(shù)據(jù)中心)8日發(fā)布的消息，由該中心與中國科學(xué)院上海巴斯德研究所聯(lián)合打造的“病毒基因組檢測分析平臺”于2021年第一個工作周正式更新上線。該平臺可進(jìn)行病毒基因檢測和進(jìn)化分析，疫情期間面向社會提供在線免費服務(wù)。
據(jù)介紹，基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學(xué)證據(jù)之一，有助疫情防控、開展各項診療。
該平臺由數(shù)據(jù)中心與中國科學(xué)院上海巴斯德研究所郝沛研究員、波蘭華沙理工大學(xué)人工智能系主任諾瓦克教授等共同研發(fā)，于2020年2月疫情期間推出，經(jīng)過更新迭代，目前該平臺可同時兼容二代基因測序數(shù)據(jù)和納米孔基因測序數(shù)據(jù)，用戶只需上傳樣本數(shù)據(jù)，即可一鍵完成檢測，在1小時內(nèi)得到分析結(jié)果，以助更全面地進(jìn)行病毒鑒定。
上海科技創(chuàng)新資源數(shù)據(jù)中心副總經(jīng)理李敏介紹，相比傳統(tǒng)的體外培養(yǎng)法和熒光PCR法，以及之前的二代病毒基因組鑒定與核酸檢查，新型基因測序在臨床病原微生物檢測中的檢測范圍更廣、準(zhǔn)確率更高，而基于納米孔測序的儀器也具有便攜性強、測序速度快等優(yōu)勢，可以在不同級別的醫(yī)院予以部署及使用。另外，數(shù)據(jù)中心基于遺傳進(jìn)化樹研發(fā)進(jìn)化分析模塊，還力求實現(xiàn)“發(fā)現(xiàn)新型病毒、鑒定傳播鏈條、發(fā)現(xiàn)超級傳播者和指導(dǎo)用藥方案”等功能。
據(jù)悉，上海科技創(chuàng)新資源數(shù)據(jù)中心還計劃將三代測序分析平臺下沉至社區(qū)醫(yī)院等基層醫(yī)療機構(gòu)，為其提供統(tǒng)一的在線分析平臺服務(wù)。(完)
